¿Se debería de usar la etiqueta noindex en una página que tiene una etiqueta rel=canonical? La respuesta es no.
Se lleva tiempo hablando de este tema, pero no ha sido hasta ahora que John Mueller de Google ha dado una respuesta clara al respecto en una conversión en Google+ que ha hecho publica John Lincoln:
Fuente: Google+ de John E Lincoln
A la pregunta: ¿Es correcto utilizar una etiqueta rel=canonical y una etiqueta no index en la misma página de una web?
Respuesta: No. No se deberían de combinar el noindex con un rel=canonical que apunte a una web indexable. Hay que elegir uno de los dos, pero no combinarlos; ya que el rel=canonical dice que las dos páginas son idénticas y el noindex dice más o menos lo contrario y que no debe indexarse.
Además no hay que olvidar que si bloqueamos una página de una web a través de robots.txt Google no verá ni el rel=canonical ni la etiqueta noindex.